Если они действуют независимо друг от друга, то думаю, да, любой из них может быть заявителем. А вот если бы речь шла о двух лицах, которые совместно осуществляют полномочия ЕИО, тогда заявления на госрегистрацию они оба должны были бы подписывать в качестве заявителей.

Если оба единоличных исполнительных органа значатся в ЕГРЮЛ, то, думаю, что заявителем может выступать любой их них. Закон говорит о том, что заявителем может быть руководитель юридического лица, не уточняя, что делать в ситуации, когда руководителя два. Значит, формально заявителем может быть любой из руководителей.

У нас сложилась такая ситуация. Уставом общества предусмотрено наличие двух единоличных исполнительных органов: Президента и Генерального директора. Компетенция их разграничена, вопрос в том, кто из них имеет право выступать заявителем, например, при подаче заявления формы Р13001 на гос. регистрацию изменений в уставе общества? Или они оба подписывают заявление?